Asrama MAn 2 Makassar adalah merupakan bantuan kementraian agama yang di danai melalui proyek SBSN.gedung asrama di peruntukkan bagi persiapan peningkatan mutu produk hasil belajar siswa yang akan mengikuti lomba lomba. contohnya lomba lomba yang diselenggarakan kementrian penddikan seperti kompetisi sains nasional,maupun  lomba atau kejuaraan yang diselenggarakan leh kementrian agama seperti Kompetisi sains madrasah,Madrasah Robotic Competition, ataupun Madrasah Young Riset.

Untuk saat ini asrama Man 2 Makassar juga dipakai untuk kegiatan kelas asrama yg di peruntukkan bagi siswa yang berasal dari luar kota maupun propinsi. siswa jalur asrama dapat memilih jalur MIPA, ips , ataupun Agama. Kelas Asrama saat ini twrdiridari 36 siswa dan di asuh oleh pembina asrama Uztadzah Hj Dra Jasmirah.