MAN 2 kota Makassar sudah memiliki 2 Asarama, 1 untuk putra dan 1 untuk putri. Asrama MAN 2 Kota Makassar tidak hanya memberikan fasilitas hunian untuk siswa MAN 2 Kota Makassar, juga menyediakan wadah untuk pembinaan keagamaan dan karakter. Hal ini sesuai dengan visi dan misi MAN 2 Kota Makassar yang tidak hanya menuntut siswanya untuk sukses dalam hal akademik tapi juga sukses dalam hal karakter atau akhlakul karimah.
Dalam menyikapi era sekarang ini yang sangat kompleks dan sangan berat, para Pembina dan pengasuh memberikan bimbingan kepada para peserta didiknya untuk senantiasa menjadi insan yang bertaqwa dan memiliki akhlak yangf muliah

Selama sepekan, para peserta didik dibimbing oleh pembina dimulai sehabis shalat magrib dengan jadwal dan agenda yang tersusun rapi. Pada hari senin (malam selasa) peserta didik mendapat tambahan pelajaran untuk memahami tafsir dan hadis hari selasa (malam rabu) para peserta didik mendapatkan kajian fiqih, pada hari rabu pembelajaran tahsin dan tajwid dan kamis pendalaman bahasa Arab menjadi pembelajaran utama, dan hari jumat dan sabtu pembelajaran Nahwu dan sharaf.

Tidak hanya kegiatan ba’da magrib, yang menjadi rutinitas tugas tambahan pendalaman keagamaan bagi para peserta didik, kegiatan selepas shalat shubuh pun juga ada. Selesai shalat shubuh para peserta didik menyetorkan hafalan al-Qur’annya satu persatu hingga waktu syuruq. Sebelum kembali asrama para peserta didik kemudian diajak untuk melaksanakan shalat syuruq bersama-sama, yaitu shalat sunat dua rakaat sebelum terbit matahari.